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与紫菱告别后，带着对紫菱的牵挂，薛林投入到北伐的事业当中。
北伐开始了。
当时的背景是，段祺瑞已经下台。当时，北洋政府控制在以张作霖为首的奉系军阀手中。直系军阀吴佩孚沦为附庸，占据两湖、河南三省和河北、陕西，控制京汉铁路。直系军阀后起之秀孙传芳占据长江中下游。
当时北洋军阀直系吴佩孚军约30万人，控制湘（湖南）、鄂（湖北）、豫（河南）等省和直隶（河北）保定一带；
从直系分化出来自成一派的孙传芳军约20万人，盘踞赣、闽、浙、皖、苏五省；奉系张作霖军约35万人，占据东北三省、热河、察哈尔、京津和山东等地。
吴、张勾结，控制北洋政府，在北方，向南口、多伦等地倾向革命的国民军进攻。
在南方，吴佩孚增兵入湘，企图联合西南军阀，进攻广东革命根据地；孙传芳在赣、闽伺机行动。
战斗序列：
国民革命军8个军10万余人（战争过程中发展到40多个军近百万人），蒋介石任总司令，李济深任总司令部参谋长，白崇禧任参谋次长代理参谋长，邓演达任政治部主任，郭沫若任政治部副主任。
何应钦、谭延闿、朱培德、李济深、李福林、程潜、李宗仁、唐生智分任第1军至第8军军长；缪斌、李富春(共…产…党员）、朱克靖（共…产…党员）、廖乾吾(共…产…党员）、李朗如、林伯渠（共…产…党员）、黄绍竑、刘文岛分任第1军至第8军党代表或副党代表。除第8军驻湖南衡山、安仁地区，第7军驻广西外，其余6个军均驻广东。
国民革命军总司令部在以V。K。布柳赫尔（化名加伦）为首的苏联军事顾问建议下，根据敌我双方军事力量对比和军阀之间的矛盾，制定了集中兵力、各个击破的战略方针。
转眼，中华大地即将旌旗密布狼烟四起……
薛林、胡宗南还是在程潜部分别任团长，钱壮为薛林副手。
战争的具体过程在这里并不多说，我只介绍大概的情况。
1926年7月4日，在广州，国民党中央临时全体会议通过《国民革命军北伐宣言》，陈述了进行北伐推翻北洋政府的理由。宣言主要内容：
“本党从来主张用和平方法，建设统一政府，盖一则中华民国之政府，应由中华人民自起而建设；一则以凋敝之民生，不堪再经内乱之祸。故总理北上之时，即谆谆以开国民会议，解决时局，号召全国。孰知段贼于国民会议，阳诺而阴拒；而帝国主义者复煽动军阀，益肆凶焰。迄于今日，不特本党召集国民会议以谋和平统一之主张未能实现，而且卖**阀吴佩孚得英帝国主义者之助，死灰复燃，竟欲效袁贼世凯之故智，大举外债，用以摧残国民**自由之运动。帝国主义者复饵以关税增收之利益，与以金钱军械之接济，直接帮助吴贼压迫中国国民革命；间接即所以谋永久掌握中国关税之权，而使中国经济生命，陷于万劫不复之地。吴贼又见国民革命之势力日益扩张，卖国借款之狡计，势难得逞，乃一面更倾其全力，攻击国民革命根据地，即使匪徒扰乱广东，又纠集党羽侵入湘省。本党至此，忍无可忍，乃不能不出于出师之一途矣。”
最后于1926年7月9日蒋中正就职国民革命军总司令并誓师北伐 。
国民政府以两广为基地，策略以“打倒吴佩孚，联络孙传芳，不理张作霖”为主，实行各个击破。进兵湖南，攻占平江、岳阳，歼灭吴佩孚的军队。
1926年8月26日，国民革命军6个团对湖北汀泗桥发起猛烈攻击，吴佩孚亲临督战，下令“退却者杀无赦”，双方互有胜负，汀泗桥几度易手，27日张发奎亲督三十五团和叶挺**团占领汀泗桥。之后双方又在贺胜桥展开激烈的白刃战，8月29日国民革命军第4、第7军取得贺胜桥大捷，8月31日，大军集结武昌城下。9月初国民革命军向武汉三镇发动攻势，6日、7日分别占领汉阳、汉口。10日国民革命军占领武昌，吴佩孚率残部逃往河南信阳。至此，吴佩孚部队基本被消灭。
国民革命军接着从两湖地区挥师东进江西，追击孙传芳，9月19日袭据南昌，为孙军击退。蒋加派援军二万人，10月20日第二次攻入南昌，又为孙军夺回。11月2日开始第三次进攻，4日克九江，7日克南昌，孙军大溃，精锐尽丧，为国民革命以来规模最大的战役。1927年3月24日二军六军占领南京。
在国民革命军于两湖地区激战时，福建的五省联军福建总司令周荫人在盟主孙传芳压力下1926年9月中以三个军2万5千人的兵力进军粤东，试图将国民革命的根据地连根拔除。
然而消息于进军前已透露，此时镇守在广东的部队为何应钦所率领的国民革命军第一军，由于周荫人于直隶出生，对闽系来说是客军而非地主，因此何应钦决定主动出击击溃其主力，同时蒋中正也派遣李大超前至闽军中收买分化，何应钦整合了广东的保安团与黄埔军校在学生作为防御主力，第一军第三师谭曙卿则作为攻击矛头于10月9日进攻周荫人之主力所暂驻的永定城，由于周部于福建之风评不佳，在永定战斗之役遭受国民革命军与城内民众的联合夹击崩溃，仅带少数侍卫逃出，同天十四师冯轶裴则于击溃闽军刘云峰旅。
此役国民革命军俘虏4000人，缴获4000余支枪械与十多门火炮。10月13日第一军于梅县松口战斗击溃刘俊、李宝珩旅，在不到一星期的时间周荫人主力部队已损失近半。
受此影响曹万顺与杜起云两旅于10月17日接受广东政府收编的建议倒戈改组为国民革命军第十七军。何应钦则升任为国民革命军东路总指挥挥军福建。
由于闽军遭东路军一路杀溃，驻守福州守军与海军第一舰队于12月2日决定接受广东政府改编，东路军于12月间占领福建全省，向浙江挺进。1927年2月底，占领浙江全境。3月22日一军进驻于**上海第三次工人暴动占领的上海。